Pelaksanaan CBT rentan berbagai masalah keamanan, seperti kebocoran soal, manipulasi data, atau bahkan serangan siber yang dapat mengacaukan sistem ujian. 

Jika sistem keamanan tidak dirancang baik, platform ujian bisa menjadi target pihak-pihak yang ingin melakukan kecurangan atau merusak integritas ujian.

Salah satu risiko utamanya kebocoran soal, yang bisa terjadi jika soal-soal ujian tersimpan tanpa perlindungan atau jika ada celah dalam sistem yang memungkinkan akses ilegal.